Versatile innovative NGS platforms

Уникальные технологии наборов для подготовки библиотек от VIP Genomics позволяют подготовить образцы к массовому параллельному секвенированию быстро, качественно и с высокой точностью, что делает их незаменимым инструментом в научных и медицинских исследованиях

Технологии
  • ПОЛНОГЕНОМНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ
    Полногеномное секвенирование (WGS) — это современный метод исследования, позволяющий получить полную информацию о ДНК организма. В отличие от традиционных подходов, когда анализируются только отдельные гены или области генома, полногеномное секвенирование охватывает весь геном целиком, что дает максимально полное представление о генетической информации.
    Технология активно используется в фундаментальной науке, клинической диагностике, персонализированной медицине, а также в сельском хозяйстве и биотехнологии.

    В отличие от таргетных методов (например, секвенирования экзома),WGS позволяет:
    • изучать как кодирующие, так и некодирующие области генома,
    • выявлять редкие мутации и структурные перестройки,
    • использовать данные для поиска наследственных заболеваний,
    • строить эволюционные и популяционные генетические модели.
    Реагенты для подготовки полногеномных библиотек VIP Genomics доступны в различных форматах наборов и оптимизированы для любых рабочих процессов, что дает максимальное удобство и гибкость использования.
    Набор VIPGen Fast Library Prep Kit позволяет создавать библиотеки ДНК высочайшего качества по технологии shotgun-секвенирования.
    Набор доступен как со встроенным этапом ферментативной фрагментации, так и без него, а для подготовки библиотек без этапа ПЦР используйте набор VIPGen PCR free Library Prep.
    Наборы совместимы с уникальными индексными праймерами VIPlate UDI TruSeq для эффективного мультиплексирования до 384 образцов в одном запуске.
    Для ультрабыстрой подготовки путем транспосомной тагментанции используйте VIPGen TagFast Library Prep Kit
  • AMPLICON / ТЕХНОЛОГИЯ AMPLISEQ
    AmpliSeq – это передовая технология таргетного секвенирования, разработанная для высокоточной и быстрой амплификации выбранных геномных регионов. Она позволяет исследовать тысячи генов или конкретные мутации из минимального количества исходного материала, что делает её идеальным решением для клинических и научных задач.

    Основные преимущества AmpliSeq:
    • Минимальные требования к образцу – для анализа достаточно нескольких нанограмм ДНК.
    • Высокая точность и чувствительность – надёжное обнаружение даже редких вариантов и низкочастотных мутаций с минимальной потерей сложных целевых локусов.
    • Скорость и эффективность – процесс подготовки библиотек занимает всего несколько часов.
    Набор VIPGen AmpliSeq Library Prep Kit v1 от VIP Genomics обеспечивает исследователям и клиницистам надёжный инструмент для анализа генома с высокой степенью детализации, открывая путь к более точной диагностике и персонализированным подходам в медицине. Набор совместим с двухиндексными праймерами VIPlate UDI TruSeq, представляющими собой 384 уникальные комбинации, раскапанные по 96-луночным планшетам. Индексация образцов во время амплификации библиотек позволяет объединять библиотеки перед кластеризацией, а также проводить мультиплексное секвенирование
  • Metagenomics / 16S/ITS / WMS
    Метагеномное секвенирование — это инструмент, который помогает не просто «увидеть» микробное сообщество, а глубоко понять его структуру, функции и роль в окружающей среде или организме.
    Современные методы секвенирования открывают уникальные возможности для изучения микробных сообществ. Метагеномный анализ позволяет исследовать весь генетический материал, содержащийся в образце - почве, воде, клиническом материале или пищевом продукте.

    Что даёт метагеномное секвенирование?
    • Определение состава микробного сообщества вплоть до штаммового уровня.
    • Выявление трудно культивируемых или ранее неизвестных микроорганизмов.
    • Анализ метаболического потенциала микробиоты.
    • Мониторинг динамики микробных сообществ при изменении условий среды.
    Набор VIPGen Meta Library Prep Kit предназначен для приготовления метагеномных библиотек для платформы секвенирования Nextera.
  • TARGET ENRICHMENT / HYBRID CAPTURE
    Технология, которая позволяет избирательно обогащать интересующие регионы генома перед секвенированием. Она обеспечивает высокую чувствительность и точность анализа, позволяя фокусироваться только на тех участках ДНК или РНК, которые имеют клиническое или исследовательское значение.

    Основные этапы:
    • Подготовка библиотеки методом “Shotgun” либо Shotgun «PCR FREE» — ДНК или РНК расщепляется на фрагменты и адаптируется для последующей гибридизации. Используйте на этом этапе набор VIPGen Fast Library Prep Kit или набор VIPGen PCR free Library Prep.
    • Гибридизация с зондами — фрагменты, соответствующие целевым регионам, связываются с биотинилированными зондами целевых панелей.
    • Выделение и обогащение — комплексы «target-зонд» извлекаются с помощью магнитных частиц.
    • Секвенирование — обогащенные фрагменты подвергаются высокопроизводительному секвенированию.

Преимущества:

  • Точность и надежность — анализируются только целевые участки генома.
  • Чувствительность — даже редкие мутации не останутся незамеченными.
  • Экономия ресурсов — меньше off-target данных, больше полезной информации.
  • Гибкость — панели можно адаптировать под ваши задачи: генетика, онкология, инфекционные болезни.

Применение:

  • Персонализированная медицина и диагностика
  • Онкологические исследования и выявление мутаций
  • Генетика наследственных заболеваний
  • Исследования редких генетических вариантов
  • RNAseq / cDNA / mRNA
    RNA-Seq (секвенирование РНК) — это передовая технология, которая позволяет изучать активность генов в клетках или тканях с высокой точностью. С ее помощью ученые могут выявлять, какие гены включены или выключены в различных условиях, например, при заболевании, воздействии лекарств или в процессе развития организма.
    Процесс RNA-Seq начинается с этапа выделения мРНК из клеток или тканей. Далее мРНК превращается в кДНК (комплементарную ДНК) с помощью фермента обратной транскриптазы. После получения кДНК, образцы подвергаются подготовке для секвенирования: добавляются адаптеры и создается библиотека, которая может быть прочитана секвенатором. Полученные последовательности затем анализируются с помощью биоинформатических инструментов, что позволяет определить уровень экспрессии каждого гена и выявить новые, ранее неизвестные транскрипты.

    Основные преимущества RNA-Seq:
    • Высокая точность и чувствительность: позволяет обнаруживать как высоко-, так и низкоэкспрессируемые гены.
    • Обнаружение новых генов и вариантов сплайсинга: RNA-Seq не ограничивается известными последовательностями, что делает его мощным инструментом для исследований.
    • Количественный анализ: уровень экспрессии каждого гена можно измерять в абсолютных или относительных единицах.
    • Гибкость применения: используется для исследований рака, иммунологии, нейробиологии и многих других областей.
  • QC & АНАЛИТИКА (QUBIT/ QPCR)

    Перед началом секвенирования крайне важно точно оценить количество и качество ДНК. Это позволяет получить стабильные и воспроизводимые результаты, а также избежать ошибок при подготовке библиотек.

    Существует два основных подхода для количественного анализа ДНК:

    1. На флуориметре (например, Qubit / Allsheng)

    Флуориметр использует специальные флуоресцентные красители, которые связываются исключительно с ДНК. Метод отличается высокой чувствительностью и точностью, позволяя измерять как низкие, так и высокие концентрации нуклеиновых кислот.

    Преимущества наборов GenFluor HS и GenFluor BR от VIP Genomics для измерения концентрации ДНК:

    • Специфичность к ДНК (минимальное влияние примесей РНК и белков)
    • Высокая точность при малых объемах образцов
    • Быстрая подготовка и измерение

    2. Метод количественной ПЦР (qPCR)

    Количественная полимеразная цепная реакция (qPCR) позволяет определить количество целевых фрагментов ДНК с высокой чувствительностью. Метод особенно полезен для оценки библиотек перед секвенированием, так как позволяет точно учитывать адаптерные последовательности.

    Преимущества:

    • Максимальная чувствительность, даже при низких концентрациях ДНК
    • Возможность определения количества именно подготовленной библиотеки
    • Высокая воспроизводимость результатов
Телефон для связи: +7 929 692-58-64
Электронная почта: info@genterra.ru
АО ГенТерра, Россия, Москва, ул. Годовикова 9с1
Made on
Tilda